除了全基因組甲基化測序技術等研究手段,對于目標基因/CpG位點甲基化檢測,需要靈活的靶向甲基化測序方案,
基于亞硫酸鹽多重PCR捕獲重點技術和NGS高深度測序的目標區(qū)域甲基化測序Targeted Bisulfite Sequencing,
滿足幾個到上百個基因/CpG位點的檢測, 具有高準確性、高通量、低成本、快周期的優(yōu)勢,
普遍用于臨床樣本多位點的甲基化Biomarker篩選、驗證及臨床轉化應用。
技術優(yōu)勢
基于亞硫酸鹽多重PCR擴增捕獲測序;
高效靈活的目標區(qū)域甲基化檢測方案;
NGS高深度測序,單堿基分辨率,絕對定量的;
適合幾個到幾百個區(qū)域/CpG位點同時檢測;
適合普遍的樣本類型:血液、組織、病理切片、灌洗液、糞便等;
低成本、快周期的,超高性價比優(yōu)勢;
重點技術,用心服務每一個項目
艾斯基因專注表觀組學10年,提供專業(yè)有價值的DNA甲基化完整解決方案;
早開發(fā)TBS技術團隊之一, 國內較早推出靶向甲基化TBS定制化服務;
已經完成血液、組織、病理切片、糞便等多種類型,10000+例樣本TBS項目經驗;
重點團隊在Genome biology、DNA Res等雜志發(fā)表多篇SCI論文;
專業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。
科學方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;
每個項目需要專業(yè)、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成果。
樣本類型 | 樣本要求 |
基因組DNA | 總量≥ 200ng; 濃度≥ 10ng/ul; 基于Qubit定量 |
細胞、血液、新鮮冷凍組織等 | 按照送樣要求準備 |
備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸 |
數據分析
TBS | 分析內容 | 備注 |
標準分析 | 1、測序數據質量評估 | 過濾掉低質量數據,保證數據質量 |
2、與目標區(qū)域序列比對 | 統(tǒng)計覆蓋度分析 | |
3、CpG位點甲基化水平統(tǒng)計 | 評估胞嘧啶甲基化狀態(tài) | |
4、不同樣本間甲基化水平比較 | 統(tǒng)計甲基化差異 | |
高級分析 | 5、臨床病理信息分析 | 甲基化與臨床信息關聯(lián)分析 |
除了全基因組甲基化測序技術等研究手段,對于目標基因/CpG位點甲基化檢測,需要靈活的靶向甲基化測序方案,
基于亞硫酸鹽多重PCR捕獲重點技術和NGS高深度測序的目標區(qū)域甲基化測序Targeted Bisulfite Sequencing,
滿足幾個到上百個基因/CpG位點的檢測, 具有高準確性、高通量、低成本、快周期的優(yōu)勢,
普遍用于臨床樣本多位點的甲基化Biomarker篩選、驗證及臨床轉化應用。
技術優(yōu)勢
基于亞硫酸鹽多重PCR擴增捕獲測序;
高效靈活的目標區(qū)域甲基化檢測方案;
NGS高深度測序,單堿基分辨率,絕對定量的;
適合幾個到幾百個區(qū)域/CpG位點同時檢測;
適合普遍的樣本類型:血液、組織、病理切片、灌洗液、糞便等;
低成本、快周期的,超高性價比優(yōu)勢;
重點技術,用心服務每一個項目
艾斯基因專注表觀組學10年,提供專業(yè)有價值的DNA甲基化完整解決方案;
早開發(fā)TBS技術團隊之一, 國內較早推出靶向甲基化TBS定制化服務;
已經完成血液、組織、病理切片、糞便等多種類型,10000+例樣本TBS項目經驗;
重點團隊在Genome biology、DNA Res等雜志發(fā)表多篇SCI論文;
專業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。
科學方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;
每個項目需要專業(yè)、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成果。
樣本類型 | 樣本要求 |
基因組DNA | 總量≥ 200ng; 濃度≥ 10ng/ul; 基于Qubit定量 |
細胞、血液、新鮮冷凍組織等 | 按照送樣要求準備 |
備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸 |
數據分析
TBS | 分析內容 | 備注 |
標準分析 | 1、測序數據質量評估 | 過濾掉低質量數據,保證數據質量 |
2、與目標區(qū)域序列比對 | 統(tǒng)計覆蓋度分析 | |
3、CpG位點甲基化水平統(tǒng)計 | 評估胞嘧啶甲基化狀態(tài) | |
4、不同樣本間甲基化水平比較 | 統(tǒng)計甲基化差異 | |
高級分析 | 5、臨床病理信息分析 | 甲基化與臨床信息關聯(lián)分析 |
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