當(dāng)前位置：

技術(shù)服務(wù)

聯(lián)系我們

張老師

18665353180

深圳市光明區(qū)鳳凰街道鳳凰社區(qū)招商局光明科技園A4棟13樓

5hmC化學(xué)捕獲測序(5hmC Seal)

羥甲基化5hmC是被認(rèn)為是哺乳動(dòng)物基因組上的第六堿基，在發(fā)育、衰老、神經(jīng)退行性疾病、復(fù)雜疾病及腫瘤發(fā)生過程中起重要作用

0755-28507994

產(chǎn)品介紹

羥甲基化5hmC是被認(rèn)為是哺乳動(dòng)物基因組上的第六堿基，在發(fā)育、衰老、神經(jīng)退行性疾病、復(fù)雜疾病及腫瘤發(fā)生過程中起重要作用;

并且在較近幾年5hmC已經(jīng)作為一種重要癌癥篩查標(biāo)志物的研究，具有重要的臨床價(jià)值;

5hmC化學(xué)捕獲測序(5hmC-Seal)通過點(diǎn)擊化學(xué)、生物素標(biāo)記捕獲等原理(Nat Biotechnol. 2011;29(1):68-72)，

減少了基于亞硫酸鹽測序?qū)NA損傷，降低了DNA輸入量的要求,

滿足不同樣本類型包括血漿cfDNA的全基因組范圍羥甲基化檢測;

普遍用于: 1) 發(fā)育和疾病甲基化機(jī)制研究; 2) 復(fù)雜疾病與腫瘤分子分型與診斷預(yù)后; 3) cfDNA羥甲基化檢測、液體活檢等臨床應(yīng)用。

重點(diǎn)技術(shù)及質(zhì)控，用心服務(wù)每一個(gè)項(xiàng)目

專注表觀組學(xué)10年，提供專業(yè)有價(jià)值的羥甲基化完整解決方案;

較早開發(fā)羥甲基化測序技術(shù)的團(tuán)隊(duì)之一，國內(nèi)較早推出多種組合的羥甲基化解決方案;

從樣本采集、cfDNA提取、建庫測序的完整cfDNA羥甲基化檢測方案;

低至5ng血漿cfDNA的5hmC Seal文庫構(gòu)建重點(diǎn)技術(shù);

自動(dòng)化樣本處理、建庫及分析流程，保障高效周期，40天極速交付;

已完成多種腫瘤組織、cfDNA及哺乳動(dòng)物羥甲基化測序及分析;

助力客戶在Genome biology, Epigenetics等雜志發(fā)表多篇論文。

樣本類型和要求

樣本類型	樣本要求
基因組DNA	總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
血漿/血清/cfDNA	建議提供2-4ml血漿/血清, 或者>15ng cfDNA
細(xì)胞、全血、動(dòng)物組織等	按照送樣要求準(zhǔn)備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸

數(shù)據(jù)分析

Seal-seq	分析內(nèi)容	備注
標(biāo)準(zhǔn)分析	1、測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估	過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量
	2、與參考基因組比對(duì)	測序Reads 在基因組上的分布
	3、5hmC Peak峰Calling	5hmC富集區(qū)域鑒定
	4、5hmC Peak圖譜分析	5hmC Peak在基因組，染色體，功能元件上的分布
	6、組間差異5hmC Peak分析	尋找DhMR及注釋
	7、差異5hmC Peak基因分析	相關(guān)基因GO，KEGG富集分析
高級(jí)分析	8、多組學(xué)整合關(guān)聯(lián)分析	例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
高級(jí)分析	9、其它定制化分析	結(jié)合課題背景亮點(diǎn)挖掘