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深圳市艾斯基因科技有限公司
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        張老師

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        深圳市光明區(qū)鳳凰街道鳳凰社區(qū)招商局光明科技園A4棟13樓

        Illumina人850K甲基化芯片

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        包含了原450K芯片91%的位點(diǎn)，又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn))
        產(chǎn)品介紹

        Illumina甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡稱850K甲基化芯片)，

        在原450K芯片的基礎(chǔ)上，推出了新一代的DNA甲基化芯片;

        包含了原450K芯片91%的位點(diǎn)，又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn));

        850K芯片覆蓋基因啟動子區(qū)、基因編碼區(qū)、CpG島以及增強(qiáng)子區(qū);

        普遍用于復(fù)雜疾病甲基化研究，以及大樣本EWAS研究的。

        850K芯片技術(shù)參數(shù)

        針對人基因組，檢測853,307個(gè)CpG位點(diǎn)，覆蓋CpG島、啟動子、編碼區(qū)、開放染色質(zhì)和增強(qiáng)子;

        同時(shí)采用Infinium I及II探針設(shè)計(jì)，使檢測范圍更大化;

        單堿基分辨率，可以直接檢測到發(fā)生甲基化的確切位點(diǎn);

        重復(fù)性較高，技術(shù)重復(fù)相關(guān)性以及與450K相同探針間的相關(guān)性R2 > 0.98;

        起始模板量低，只需 250ng;適用于FFPE樣本。

        樣本類型和要求

        樣本類型

        樣本要求

        人基因組DNA

        總量≥ 2ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

        細(xì)胞、全血、新鮮冷凍組織等

        按照送樣要求準(zhǔn)備

        備注：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸

        信息分析

        850K芯片

        分析內(nèi)容

        標(biāo)準(zhǔn)分析

        1．原始數(shù)據(jù)預(yù)處理

        2．?dāng)?shù)據(jù)歸一化（甲基化位點(diǎn)總表，含注釋信息)

        3．QC結(jié)果（beta值密度曲線，聚類圖，PCA圖，相關(guān)性圖）

        4．差異甲基化位點(diǎn)（含注釋信息）

        5．差異甲基化位點(diǎn)的染色體分布

        6．差異甲基化位點(diǎn)的基因功能注釋與富集

        7．差異甲基化位點(diǎn)的熱圖展示

        高級分析

        8、特定基因組區(qū)段的DMR展示

        9、甲基化與轉(zhuǎn)錄的關(guān)聯(lián)分析

        10、其它定制化分析


        Illumina人850K甲基化芯片

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        包含了原450K芯片91%的位點(diǎn)，又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn))
        0755-28507994
        產(chǎn)品介紹

        Illumina甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡稱850K甲基化芯片)，

        在原450K芯片的基礎(chǔ)上，推出了新一代的DNA甲基化芯片;

        包含了原450K芯片91%的位點(diǎn)，又增加了413,745個(gè)位點(diǎn)(總共853,307個(gè)CpG位點(diǎn));

        850K芯片覆蓋基因啟動子區(qū)、基因編碼區(qū)、CpG島以及增強(qiáng)子區(qū);

        普遍用于復(fù)雜疾病甲基化研究，以及大樣本EWAS研究的。

        850K芯片技術(shù)參數(shù)

        針對人基因組，檢測853,307個(gè)CpG位點(diǎn)，覆蓋CpG島、啟動子、編碼區(qū)、開放染色質(zhì)和增強(qiáng)子;

        同時(shí)采用Infinium I及II探針設(shè)計(jì)，使檢測范圍更大化;

        單堿基分辨率，可以直接檢測到發(fā)生甲基化的確切位點(diǎn);

        重復(fù)性較高，技術(shù)重復(fù)相關(guān)性以及與450K相同探針間的相關(guān)性R2 > 0.98;

        起始模板量低，只需 250ng;適用于FFPE樣本。

        樣本類型和要求

        樣本類型

        樣本要求

        人基因組DNA

        總量≥ 2ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

        細(xì)胞、全血、新鮮冷凍組織等

        按照送樣要求準(zhǔn)備

        備注：用封口膜密封樣品; 干冰運(yùn)輸

        信息分析

        850K芯片

        分析內(nèi)容

        標(biāo)準(zhǔn)分析

        1．原始數(shù)據(jù)預(yù)處理

        2．?dāng)?shù)據(jù)歸一化（甲基化位點(diǎn)總表，含注釋信息)

        3．QC結(jié)果（beta值密度曲線，聚類圖，PCA圖，相關(guān)性圖）

        4．差異甲基化位點(diǎn)（含注釋信息）

        5．差異甲基化位點(diǎn)的染色體分布

        6．差異甲基化位點(diǎn)的基因功能注釋與富集

        7．差異甲基化位點(diǎn)的熱圖展示

        高級分析

        8、特定基因組區(qū)段的DMR展示

        9、甲基化與轉(zhuǎn)錄的關(guān)聯(lián)分析

        10、其它定制化分析


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